⚠️ À lire avant tout
La greffe fécale est un acte médical. Ne tentez jamais de la faire vous-même avec les selles d’un proche : même dans le cadre contrôlé d’essais cliniques, des infections graves ont été transmises. Si votre côlon irritable vous gâche la vie, parlez-en à votre médecin ou à un gastro-entérologue. Cet article explique une étude, il ne remplace pas un avis médical.
Le plus grand essai mené à ce jour sur la greffe fécale contre le syndrome de l’intestin irritable vient d’être publié dans The Lancet, le 24 septembre 2026. Son résultat est clair : sur 450 patients norvégiens, recevoir les selles d’un donneur en bonne santé n’a pas fait mieux que recevoir ses propres selles. 40 % des patients se sont sentis nettement mieux après la greffe, contre 38 % dans le groupe placebo. Après plusieurs petits essais encourageants, c’est un coup d’arrêt pour l’une des pistes les plus médiatisées autour du microbiote. Voici ce que l’étude a testé, pourquoi son résultat surprend, et ce qu’il change concrètement si vous souffrez du côlon irritable.
🔑 L’essentiel
- L’essai REFIT2 : 450 adultes avec un côlon irritable modéré à sévère, dans 5 hôpitaux norvégiens. Une seule greffe, par lavement.
- Le résultat : 40 % d’amélioration nette avec les selles d’un donneur, 38 % avec ses propres selles. Aucune différence réelle.
- Pourquoi c’est important : cet essai compte à lui seul l’équivalent des deux tiers des patients des 13 essais précédents réunis.
- Ce que ça change : la greffe fécale n’est pas un traitement du côlon irritable. En France, elle est réservée aux infections récidivantes à Clostridioides difficile et aux essais cliniques.
- Ce que ça ne dit pas : que le microbiote ne joue aucun rôle dans le côlon irritable, ni que les autres approches (alimentation, fibres, certaines souches de probiotiques) sont inutiles.
La greffe fécale, c’est quoi ?
La greffe (ou transplantation) de microbiote fécal consiste à transférer les selles d’un donneur en bonne santé, préparées et filtrées, dans l’intestin d’un malade. L’idée est de remplacer un microbiote déséquilibré par un microbiote sain. Elle a fait ses preuves dans une maladie précise : les infections intestinales à répétition par la bactérie Clostridioides difficile. Notre guide pour reconstituer sa flore en parle dans sa partie sur les traitements avancés.
Comme le microbiote des personnes atteintes du côlon irritable est souvent différent de celui des autres, plusieurs équipes ont voulu savoir si une greffe pouvait soulager leurs symptômes : douleurs, ballonnements, diarrhée ou constipation.
Ce que l’essai REFIT2 a testé
L’étude a été conduite dans cinq hôpitaux norvégiens entre 2021 et 2022, avec un financement public. Elle a inclus des adultes de 18 à 65 ans, avec un côlon irritable diagnostiqué selon les critères internationaux de référence (Rome IV) et des symptômes au moins modérés : un score d’au moins 175 points sur l’échelle de sévérité utilisée dans la plupart des essais (IBS-SSS, notée sur 500).
- Deux groupes tirés au sort : deux patients sur trois recevaient les selles d’un donneur sain, un sur trois recevait ses propres selles, ce qui sert de placebo.
- En double aveugle : ni les patients ni les soignants ne savaient qui avait reçu quoi.
- Une seule greffe, administrée par lavement rectal.
- Le critère de réussite : une baisse d’au moins 75 points du score de symptômes, 90 jours après la greffe.
Sur 2 304 personnes examinées, 450 ont été incluses. Deux tiers étaient des femmes, et la moitié avait moins de 36 ans.
Le résultat : 40 % contre 38 %
| Groupe | Patients | Nettement améliorés à 90 jours |
|---|---|---|
| Selles d’un donneur sain | 299 | 119 (40 %) |
| Ses propres selles (placebo) | 151 | 57 (38 %) |
L’écart n’est que de 1,9 point, et il peut s’expliquer par le hasard. Les effets indésirables étaient aussi fréquents dans les deux groupes. Les auteurs concluent que l’essai ne montre pas de bénéfice clinique, et que modifier le microbiote seul ne suffit peut-être pas à améliorer les symptômes du côlon irritable.
Un autre chiffre mérite qu’on s’y arrête : près de quatre patients sur dix se sont nettement améliorés en recevant… leurs propres selles. C’est l’effet placebo, particulièrement fort dans le côlon irritable, dont les symptômes varient beaucoup d’une période à l’autre. C’est la raison pour laquelle un traitement qui « marche » sans groupe placebo ne prouve presque rien dans cette maladie.
Pourquoi ce résultat surprend
Les essais précédents donnaient des résultats contradictoires, et certains étaient très positifs. Le plus frappant : en 2018, la même équipe norvégienne avait obtenu un résultat favorable avec 90 patients.
| Essai | Patients | Comment | Résultat |
|---|---|---|---|
| Johnsen, 2018 (Norvège) | 90 | Une greffe par coloscopie | ✅ 65 % améliorés contre 43 % sous placebo, de justesse |
| Halkjær, 2018 (Danemark) | 52 | Gélules pendant 12 jours | ❌ Le groupe placebo allait mieux à 3 mois |
| Aroniadis, 2019 (États-Unis) | 48 | Gélules sur 3 jours | ❌ Aucune différence, essai arrêté faute d’effet |
| El-Salhy, 2020 (Norvège) | 165 | Un seul « super-donneur » sélectionné, greffe par gastroscopie | ✅ 77 à 89 % de répondeurs contre 24 % |
| REFIT2, 2026 (Norvège) | 450 | Une greffe par lavement | ❌ 40 % contre 38 % |
En mai 2026, quelques mois avant REFIT2, une méta-analyse publiée dans la revue Gastroenterology avait rassemblé 13 essais et 693 patients. Elle concluait à un bénéfice possible, mais avec un niveau de certitude « très faible » : quand on compte tous les patients tirés au sort, l’effet n’était pas significatif. REFIT2 ajoute 450 patients d’un coup, avec un résultat nul.
Comment expliquer un tel écart ?
Personne ne peut encore le dire avec certitude, et The Lancet a d’ailleurs accompagné l’essai d’un commentaire consacré à l’interprétation de ce résultat négatif. Plusieurs pistes sont discutées :
- La taille des essais : en médecine, les petits essais positifs sont souvent démentis par de plus grands. Un essai de 450 patients est bien moins sensible au hasard qu’un essai de 50.
- La façon de faire la greffe : REFIT2 a utilisé un seul lavement, alors que les deux essais positifs déposaient les selles plus loin dans l’intestin, par coloscopie ou par gastroscopie. Une petite étude de la même équipe, menée en 2023 chez 8 volontaires avec un liquide de contraste, a montré qu’un lavement n’atteint le début du côlon que dans 38 à 50 % des cas, contre 100 % avec une coloscopie. Reste à savoir si cela change l’efficacité : personne ne l’a encore prouvé.
- Le donneur : l’essai le plus positif, celui d’El-Salhy, reposait sur un seul donneur choisi pour son microbiote. Ce résultat n’a pas été reproduit à grande échelle.
- La barre de réussite : El-Salhy comptait une baisse de 50 points comme une réponse, REFIT2 exigeait 75 points. Les chiffres de « répondeurs » ne se comparent donc pas directement d’un essai à l’autre.
Les auteurs de l’essai, eux, retiennent une explication plus simple : modifier le microbiote seul ne suffit peut-être pas à améliorer les symptômes. Le commentaire du Lancet, signé Jacqueline Liu et Andrea Shin, va dans le même sens en rappelant que le côlon irritable met en jeu plusieurs mécanismes liés au dialogue entre l’intestin et le cerveau, et que les traitements actuels soulagent surtout les symptômes. Le côlon irritable ne se résume pas à un déséquilibre des bactéries : la sensibilité de l’intestin, le dialogue entre l’intestin et le cerveau, le stress ou l’alimentation comptent aussi.
Ce que ça change pour vous
La greffe fécale n’est pas un traitement du côlon irritable
En France, la greffe fécale est encadrée par l’Agence nationale de sécurité du médicament (ANSM). Elle est pratiquée dans les CHU pour une seule indication validée, les infections récidivantes à Clostridioides difficile, et pour le reste uniquement dans le cadre d’essais cliniques autorisés. Aux États-Unis, l’Association américaine de gastro-entérologie (AGA) déconseillait déjà en 2024 la greffe fécale classique contre le côlon irritable, sauf dans le cadre d’essais cliniques. Après REFIT2, il n’y a aucune raison de la chercher en dehors de ce cadre.
Ne la faites jamais vous-même
On trouve en ligne des conseils pour faire une greffe « maison ». Le risque est réel : en 2019, le New England Journal of Medicine a décrit deux patients qui ont contracté une infection du sang par une bactérie résistante aux antibiotiques, transmise par le même donneur, alors qu’ils étaient suivis dans des essais cliniques. L’un d’eux est mort. Si cela peut arriver dans un essai encadré, le risque est bien plus grand avec les selles d’un proche dont personne n’a vérifié les bactéries.
Ce qui peut aider à la place
Le côlon irritable se soigne rarement avec une solution unique. Les approches les mieux étudiées, à discuter avec votre médecin ou un diététicien, sont :
- un régime pauvre en FODMAP, sur quelques semaines puis avec une réintroduction progressive : voir notre article sur le régime FODMAP et notre liste des aliments FODMAP ;
- les fibres solubles, comme le psyllium, introduites progressivement ;
- certaines souches de probiotiques testées dans le côlon irritable, à condition de choisir la bonne souche à la bonne dose : notre article sur les probiotiques et le côlon irritable fait le tri.
Ce que l’essai ne dit pas
- Il ne remet pas en cause la greffe contre Clostridioides difficile, où son efficacité est bien établie.
- Il ne prouve pas que le microbiote ne joue aucun rôle dans le côlon irritable. Il montre qu’une greffe unique par lavement ne soulage pas les symptômes.
- Il ne teste pas toutes les façons de faire : greffes répétées, autres voies d’administration ou donneurs sélectionnés restent possibles à étudier, mais rien ne permet aujourd’hui de les recommander.
🩺 Quand consulter
Un côlon irritable se diagnostique chez un médecin, après avoir écarté d’autres maladies. Consultez sans tarder en cas de sang dans les selles, de perte de poids inexpliquée, de fièvre, de symptômes qui vous réveillent la nuit, de changement récent du transit après 50 ans, ou d’antécédents familiaux de cancer du côlon ou de maladie inflammatoire de l’intestin.
📚 Sources
- Johnsen P.H. et al. Faecal microbiota transplantation in irritable bowel syndrome (REFIT2): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 trial. The Lancet, 24 septembre 2026. PMID 42785338
- Liu J., Shin A. Healthy donor faecal microbiota transplantation in irritable bowel syndrome: interpreting negative findings (commentaire). The Lancet, 24 septembre 2026. PMID 42785337
- Johnsen P.H. et al. Faecal microbiota transplantation versus placebo for moderate-to-severe irritable bowel syndrome. Lancet Gastroenterol Hepatol, 2018. PMID 29100842
- Halkjær S.I. et al. Faecal microbiota transplantation alters gut microbiota in patients with irritable bowel syndrome. Gut, 2018. PMID 29980607
- Aroniadis O.C. et al. Faecal microbiota transplantation for diarrhoea-predominant irritable bowel syndrome. Lancet Gastroenterol Hepatol, 2019. PMID 31326345
- El-Salhy M. et al. Efficacy of faecal microbiota transplantation for patients with irritable bowel syndrome in a randomised, double-blind, placebo-controlled study. Gut, 2020. PMID 31852769
- Fecal Microbiota Transplantation for Symptom Improvement in Patients With Irritable Bowel Syndrome: Systematic Review and Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials. Gastroenterology, 2026. PMID 42162772
- Skjevling L.K. et al. Colonic distribution of FMT by different enema procedures compared to colonoscopy: proof of concept study using contrast fluid. BMC Gastroenterol, 2023. PMID 37872499
- Peery A.F. et al. AGA Clinical Practice Guideline on Fecal Microbiota-Based Therapies for Select Gastrointestinal Diseases. Gastroenterology, 2024. PMID 38395525
- DeFilipp Z. et al. Drug-Resistant E. coli Bacteremia Transmitted by Fecal Microbiota Transplant. N Engl J Med, 2019. PMID 31665575
- ANSM. Comité scientifique temporaire « Transplantation de microbiote fécal », compte rendu du 21 janvier 2021. ansm.sante.fr, consulté le 04/10/2026.
